Juan 24/11/2016: job_{} , upgrade to MNH-5-2-2
authorJuan Escobar <escj@aero.obs-mip.fr>
Thu, 24 Nov 2016 16:56:33 +0000 (17:56 +0100)
committerJuan Escobar <escj@aero.obs-mip.fr>
Thu, 24 Nov 2016 16:56:33 +0000 (17:56 +0100)
21 files changed:
src/job_make_examples_BG
src/job_make_examples_BGQ
src/job_make_examples_BullX
src/job_make_examples_BullX_eos
src/job_make_examples_CRAY_cca
src/job_make_examples_IBM_ada
src/job_make_examples_IBM_sp6_vargas
src/job_make_examples_NEC_SX8
src/job_make_examples_SX8
src/job_make_examples_cxa
src/job_make_mesonh_BG
src/job_make_mesonh_BGQ
src/job_make_mesonh_BullX
src/job_make_mesonh_CRAY_cca
src/job_make_mesonh_IBM_ada
src/job_make_mesonh_IBM_sp6_vargas
src/job_make_mesonh_MFSX8
src/job_make_mesonh_NEC_SX8
src/job_make_mesonh_cxa
src/job_make_mesonh_user_BullX
src/job_make_mesonh_user_MFSX8

index 9ac36da..9c4c9fa 100755 (executable)
@@ -18,7 +18,7 @@
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-.  ../conf/profile_mesonh-BGI4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O2
+.  ../conf/profile_mesonh-BGI4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O2
 
 
 #001_2Drelief 002_3Drelief 003_KW78 004_Reunion 007_16janvier
 
 
 #001_2Drelief 002_3Drelief 003_KW78 004_Reunion 007_16janvier
index 685ebfd..786b5a6 100755 (executable)
@@ -18,7 +18,7 @@
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-. ../conf/profile_mesonh-BGQI4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O2NAN
+. ../conf/profile_mesonh-BGQI4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O2NAN
 
 set -x
 
 
 set -x
 
index ea6a534..b81f2d5 100755 (executable)
@@ -19,7 +19,7 @@ set -e
 # Nom de la machine
 hostname 
 
 # Nom de la machine
 hostname 
 
-. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-1-MPIINTEL-O3
+. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-2-MPIINTEL-O3
 export MONORUN="mpirun -np 1 "
 export MPIRUN="mpirun -np 2 "
 export POSTRUN="time "
 export MONORUN="mpirun -np 1 "
 export MPIRUN="mpirun -np 2 "
 export POSTRUN="time "
index dd2ac76..49d7de2 100755 (executable)
@@ -1,12 +1,12 @@
 #!/bin/bash
 #SBATCH -J Examples
 #!/bin/bash
 #SBATCH -J Examples
-#SBATCH -N 1            # nodes number
+#SBATCH -N 2            # nodes number
 #SBATCH -n 4            # CPUs number (on all nodes) 
 #SBATCH --exclusive           
 #SBATCH -o Examples.eo%j   #
 #SBATCH -e Examples.eo%j   #
 #SBATCH -t 01:00:00    # time limit
 #SBATCH -n 4            # CPUs number (on all nodes) 
 #SBATCH --exclusive           
 #SBATCH -o Examples.eo%j   #
 #SBATCH -e Examples.eo%j   #
 #SBATCH -t 01:00:00    # time limit
-##SBATCH --export=NONE
+#SBATCH --export=NONE
 
 # Echo des commandes
 ulimit -c 0
 
 # Echo des commandes
 ulimit -c 0
@@ -17,9 +17,9 @@ set -x
 # Nom de la machine
 hostname 
 
 # Nom de la machine
 hostname 
 
-. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-1-MPIINTEL-O2
-export MONORUN="mpirun -genv I_MPI_PIN_PROCESSOR_LIST=all:map=spread -prepend-rank -np 1 "
-export MPIRUN="mpirun -genv I_MPI_PIN_PROCESSOR_LIST=all:map=spread -prepend-rank -np 4 "
+. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-2-MPIINTEL-O2
+export MONORUN="mpirun -prepend-rank -np 1 "
+export MPIRUN="mpirun -prepend-rank -np 4 "
 export POSTRUN="time "
 
 cd $SRC_MESONH/MY_RUN/KTEST/003_KW78 
 export POSTRUN="time "
 
 cd $SRC_MESONH/MY_RUN/KTEST/003_KW78 
index 7f1842d..643008d 100755 (executable)
@@ -27,7 +27,7 @@ cd ${PBS_O_WORKDIR}
 
 #ARCH=LXifort
 ARCH=LXcray
 
 #ARCH=LXifort
 ARCH=LXcray
-. ../conf/profile_mesonh-${ARCH}I4-MNH-V5-2-1-MPICRAY-O2
+. ../conf/profile_mesonh-${ARCH}I4-MNH-V5-2-2-MPICRAY-O2
 
 
 export MONORUN="aprun -n 1 "
 
 
 export MONORUN="aprun -n 1 "
index 67746ff..658353f 100755 (executable)
@@ -19,7 +19,7 @@
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-1-MPIINTEL-O2
+. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-2-MPIINTEL-O2
 
 # Pour avoir l'echo des commandes
 set -x
 
 # Pour avoir l'echo des commandes
 set -x
index 59c7b3b..53f2862 100755 (executable)
@@ -24,7 +24,7 @@
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-.  ../conf/profile_mesonh-AIX64-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O2
+.  ../conf/profile_mesonh-AIX64-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O2
 
 
 #001_2Drelief 002_3Drelief 003_KW78 004_Reunion 007_16janvier
 
 
 #001_2Drelief 002_3Drelief 003_KW78 004_Reunion 007_16janvier
index eba96f2..79d2685 100755 (executable)
@@ -18,7 +18,7 @@ hostname
 
 [ -d $PBS_O_WORKDIR ] && cd $PBS_O_WORKDIR
 #
 
 [ -d $PBS_O_WORKDIR ] && cd $PBS_O_WORKDIR
 #
-. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O4
+. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O4
 
 export MONORUN="Mpirun -np 1 "
 export MPIRUN="Mpirun -np 2 "
 
 export MONORUN="Mpirun -np 1 "
 export MPIRUN="Mpirun -np 2 "
index 2b4a069..270a094 100755 (executable)
@@ -19,7 +19,7 @@ hostname
 [ -d $PBS_O_WORKDIR ] && cd $PBS_O_WORKDIR
 #
 
 [ -d $PBS_O_WORKDIR ] && cd $PBS_O_WORKDIR
 #
 
-. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O2
+. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O2
 
 export MONORUN="Mpirun -np 1 "
 export MPIRUN="Mpirun -np 2 "
 
 export MONORUN="Mpirun -np 1 "
 export MPIRUN="Mpirun -np 2 "
index 706d988..913e2ca 100755 (executable)
@@ -34,7 +34,7 @@ echo SHELL=$SHELL
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-.  ../conf/profile_mesonh-AIX64I4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O2
+.  ../conf/profile_mesonh-AIX64I4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O2
 
 ulimit -c 0 # pas de core
 
 
 ulimit -c 0 # pas de core
 
index 8644617..ae0cb1e 100755 (executable)
@@ -18,7 +18,7 @@
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-. ../conf/profile_mesonh-BGI4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O2          
+. ../conf/profile_mesonh-BGI4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O2          
 
 #time gmake 
 time gmake -r -j8
 
 #time gmake 
 time gmake -r -j8
index e213ca1..7e16869 100755 (executable)
@@ -34,7 +34,7 @@ set -x
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-. ../conf/profile_mesonh-BGQI4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O2NAN
+. ../conf/profile_mesonh-BGQI4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O2NAN
 
 case $LOADL_STEP_NAME in
 
 
 case $LOADL_STEP_NAME in
 
index fd375e5..cbd22ba 100755 (executable)
@@ -19,7 +19,7 @@ set -x
 # On va lancer la compilation dans le répertoire de lancement du job
 pwd
 
 # On va lancer la compilation dans le répertoire de lancement du job
 pwd
 
-. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-1-MPIINTEL-O3
+. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-2-MPIINTEL-O3
 
 time gmake -j 4
 time gmake -j 1 installmaster
 
 time gmake -j 4
 time gmake -j 1 installmaster
index 77af67e..f37bccc 100755 (executable)
@@ -21,7 +21,7 @@ pwd
 
 #ARCH=LXifort
 ARCH=LXcray
 
 #ARCH=LXifort
 ARCH=LXcray
-. ../conf/profile_mesonh-${ARCH}I4-MNH-V5-2-1-MPICRAY-O2
+. ../conf/profile_mesonh-${ARCH}I4-MNH-V5-2-2-MPICRAY-O2
 
 
 time gmake -j 4 2>&1 | tee sortie_compile_cray.$$
 
 
 time gmake -j 4 2>&1 | tee sortie_compile_cray.$$
index 118d7df..51c678f 100755 (executable)
@@ -16,7 +16,7 @@
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-1-MPIINTEL-O2
+. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-2-MPIINTEL-O2
 
 # Pour avoir l'echo des commandes
 set -x
 
 # Pour avoir l'echo des commandes
 set -x
index 8c77dba..4b7d25e 100755 (executable)
@@ -24,7 +24,7 @@
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-. ../conf/profile_mesonh-AIX64I4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O2
+. ../conf/profile_mesonh-AIX64I4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O2
 
 time gmake -j1 gribapi
 time gmake -r -j8
 
 time gmake -j1 gribapi
 time gmake -r -j8
index f939d6f..8728a6d 100644 (file)
@@ -12,7 +12,7 @@ set -x
 # On va lancer la compilation dans le répertoire de lancement du job
 [ ${PBS_O_WORKDIR} ] && cd ${PBS_O_WORKDIR}
 
 # On va lancer la compilation dans le répertoire de lancement du job
 [ ${PBS_O_WORKDIR} ] && cd ${PBS_O_WORKDIR}
 
-. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O4 
+. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O4 
 
 time gmake  -j 4  ########## compile on four processors to speedup the compilation
 time gmake  -j 1 installmaster
 
 time gmake  -j 4  ########## compile on four processors to speedup the compilation
 time gmake  -j 1 installmaster
index e70939f..72a8dcf 100755 (executable)
@@ -11,7 +11,7 @@ set -x
 # On va lancer la compilation dans le répertoire de lancement du job
 [ $PBS_O_WORKDIR ] && cd $PBS_O_WORKDIR
 
 # On va lancer la compilation dans le répertoire de lancement du job
 [ $PBS_O_WORKDIR ] && cd $PBS_O_WORKDIR
 
-. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O4
+. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O4
 
 time gmake  -j 4  
 time gmake  -j 4   #  some time problem with first pass in parallel compilation
 
 time gmake  -j 4  
 time gmake  -j 4   #  some time problem with first pass in parallel compilation
index 1fbebd0..71c545f 100755 (executable)
@@ -27,7 +27,7 @@
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
 set -x
 cd $LOADL_STEP_INITDIR
 
-.  ../conf/profile_mesonh-AIX64I4-MNH-V5-2-1-MPIAUTO-O2
+.  ../conf/profile_mesonh-AIX64I4-MNH-V5-2-2-MPIAUTO-O2
 
 time gmake -r -j1
 time gmake installmaster
 
 time gmake -r -j1
 time gmake installmaster
index 4ae34bf..903ddaf 100755 (executable)
@@ -19,7 +19,7 @@ export VER_USER=                ########## Your own USER Directory
 set -x
 
 # On va lancer la compilation dans le répertoire de lancement du job
 set -x
 
 # On va lancer la compilation dans le répertoire de lancement du job
-. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-1-${VER_USER}-MPIINTEL-O3
+. ../conf/profile_mesonh-LXifortI4-MNH-V5-2-2-${VER_USER}-MPIINTEL-O3
 
 time gmake user
 time gmake -j 1 installuser
 
 time gmake user
 time gmake -j 1 installuser
index bf7c6f3..604d91a 100644 (file)
@@ -14,7 +14,7 @@ set -x
 [ ${PBS_O_WORKDIR} ] && cd ${PBS_O_WORKDIR}
 
 
 [ ${PBS_O_WORKDIR} ] && cd ${PBS_O_WORKDIR}
 
 
-. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-1-${VER_USER}-MPIAUTO-O4
+. ../conf/profile_mesonh-SX8I4-MNH-V5-2-2-${VER_USER}-MPIAUTO-O4
 
 time gmake user
 time gmake -j 1 installuser
 
 time gmake user
 time gmake -j 1 installuser