MesonhTEAMFAQ/MesoNH_HYBRIDE


NUWA


Avancement

Environnent PGI & Librairie MPI


Compilateur

export MODULEPATH=~sila/sila_modules:$MODULEPATH
module avail pgi/15
module load pgi/15.09


Librairie MPI

export MODULEPATH=~escj/my_modules:$MODULEPATH
module avail ompi
module load ompi/1.8.5-pgi-15.4-gpudirect

export MODULEPATH=~mesonh/my_modules:$MODULEPATH
module avail mva
module load mvapich2/2.0b-ifort14.0.1-mic-smpcall


Mesonh 5-1-3 + OpenACC en beta test

/home/escj/DEV64/MNH-V5-1-2/src/ACC_PGI_GOODDIR2_NUWA-MPIAUTO-CUDA
. /home/escj/DEV64/MNH-V5-1-2/conf/profile_mesonh-LXpgiI4-MNH-V5-1-2-PGI154-ACC_PGI_GOODDIR2_NUWA-MPIAUTO-CUDA

OPT_CUDA  =  -g -O2 -Kieee -nofma -Mcuda=nordc -ta=host,tesla,nofma,cc35,cuda6.5,nordc -Minfo=ccff,accel -Mprof=ccff

cd /home/escj/DEV64/MNH-V5-1-2/MY_RUN/KTEST/003_KW78_ACC_PGI_GOODDIR_256/002_mesonh
run_mesonh_xyz_mppdb

cd ~escj/bin/
escj@nuwa:~/bin> ls -lrt ~/bin/XtermGpu3*
-rwxr-xr-x 1 escj MESO 66 Jan 30  2013 /home/escj/bin/XtermGpu370
-rwxr-xr-x 1 escj MESO 71 Jan 31  2013 /home/escj/bin/XtermGpu370-1
-rwxr-xr-x 1 escj MESO 66 Feb  8  2013 /home/escj/bin/XtermGpu371
-rwxr-xr-x 1 escj MESO 66 Sep  5  2014 /home/escj/bin/XtermGpu373
-rwxr-xr-x 1 escj MESO 66 Feb 23  2015 /home/escj/bin/XtermGpu372
-rwxr-xr-x 1 escj MESO 71 May 29 11:16 /home/escj/bin/XtermGpu372-3
Gsub XtermGpu370   # Pour 1 noeud
Gsub XtermGpu370-1 # Pour Les noeuds 370/371

export ACC_DEVICE=NVIDIA # exécution sur GPU
export ACC_DEVICE=HOST   # exécution sur CPU


Outils n'analyse de performance

---

pgcollect/pgprof

pgf90 -g -Minfo=all,ccff ...

pgcollect a.out

Mpirun --mca btl ^openib ... -np 32 set_device mpicollect 


nvprof


cuda7.5

OCCIGEN-CVT


20-21 janvier 2016 , WorkShopX86 a la Maison de la Simulation

munoz@occigen55:~/SHARED_CVT$ /bin/pwd
/panfs/panasas/cnt0041/cvt1600/SHARED

munoz@occigen55:~/SHARED_CVT$ ls -lrt 
total 26128
-rwxr-xr-x 1 hautreux   cnu0001   341344 19 janv. 10:58 genci_metrics_collection.pdf
-rwxr-xr-x 1 bourrasset cnu0001      569 20 janv. 15:34 run_example.SLURM
-rwxr-xr-x 1 mbycklin   cvt1600     1024 20 janv. 15:58 slurm_example.sh
-rw-r--r-- 1 derouilj   cvt1606      258 20 janv. 17:42 env.sh
-rw-r--r-- 1 hautreux   cnu0001     5435 21 janv. 09:11 Performance_metrics.txt
-rw-r--r-- 1 mhaefele   cvt1611 18442862 21 janv. 11:29 metalwalls.tgz
-rw-r--r-- 1 abuttari   cvt1616     6593 21 janv. 11:47 Performance_metrics_qr_mumps.txt
drwxr-xr-x 2 dlecas     cvt1600     4096 21 janv. 11:57 HYDRO
-rw-r--r-- 1 ghlartigue cvt1603     6432 21 janv. 16:22 Performance_metrics_yales2_aero.txt
-rw-r--r-- 1 ghlartigue cvt1603     6187 21 janv. 16:22 Performance_metrics_yales2_combustion.txt
-rw-r--r-- 1 ymknl      cvt1601     2070 21 janv. 17:01 job_advisor
-rw-r--r-- 1 ymknl      cvt1601     5826 21 janv. 17:27 Performance_metrics_DYNAMICO.txt
-rw-r--r-- 1 hautreux   cnu0001  1819181 21 janv. 17:43 01 Intel Xeon Phi Architecture.pdf
-rw-r--r-- 1 hautreux   cnu0001  1820508 21 janv. 17:43 02 VTune and MPS.PDF
-rw-r--r-- 1 derouilj   cvt1606     6421 29 janv. 15:49 Performance_metrics_Smilei.txt
-rw-r--r-- 1 dlecas     cvt1613     5970 29 janv. 15:53 Performance_metrics_HYDRO.txt
-rw-r--r-- 1 fauchet    cvt1604    45716  3 févr. 10:15 trust_report.html
-rw-r--r-- 1 ebrun      cvt1614     6573  3 févr. 13:54 Performance_metrics_PATMOS.txt
-rw-r--r-- 1 ebrun      cvt1614    47388  3 févr. 13:54 PATMOS_MPS_report.html

Mesonh-54: MesonhTEAMFAQ/MesoNH_HYBRIDE (last edited 2016-02-19 17:49:34 by JuanEscobar)